Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLGNO14967 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLGNO14967 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLGNO14967 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLGNO14967 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLGNO14967 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLGNO14967 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLGNO14967 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLGNO14967 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLGNO14967 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLGNO14967 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLGNO14967 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLGNO14967 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLGNO14967 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLGNO14967 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLGNO14967 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLGNO14967 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLGNO14967 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLGNO14967 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLGNO14967 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLGNO14967 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms