Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF6O14896 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF6O14896 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF6O14896 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF6O14896 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF6O14896 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF6O14896 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRF6O14896 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRF6O14896 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF6O14896 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF6O14896 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF6O14896 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF6O14896 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF6O14896 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IRF6O14896 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF6O14896 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF6O14896 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF6O14896 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF6O14896 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF6O14896 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF6O14896 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF6O14896 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF6O14896 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF6O14896 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF6O14896 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF6O14896 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF6O14896 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF6O14896 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF6O14896 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF6O14896 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF6O14896 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF6O14896 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF6O14896 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF6O14896 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF6O14896 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF6O14896 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF6O14896 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF6O14896 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF6O14896 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF6O14896 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF6O14896 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF6O14896 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF6O14896 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF6O14896 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF6O14896 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF6O14896 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF6O14896 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF6O14896 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF6O14896 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF6O14896 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRF6O14896 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRF6O14896 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRF6O14896 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRF6O14896 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF6O14896 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF6O14896 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF6O14896 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF6O14896 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF6O14896 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF6O14896 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF6O14896 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF6O14896 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF6O14896 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF6O14896 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF6O14896 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF6O14896 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF6O14896 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF6O14896 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF6O14896 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF6O14896 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF6O14896 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF6O14896 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF6O14896 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF6O14896 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF6O14896 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF6O14896 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF6O14896 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF6O14896 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF6O14896 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF6O14896 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF6O14896 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF6O14896 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF6O14896 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF6O14896 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF6O14896 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF6O14896 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF6O14896 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF6O14896 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF6O14896 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms