Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHOX2AO14813 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHOX2AO14813 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2AO14813 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms