Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2CO00762 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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UBE2CO00762 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2CO00762 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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