Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME4O00746 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME4O00746 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME4O00746 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME4O00746 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME4O00746 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME4O00746 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME4O00746 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME4O00746 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME4O00746 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME4O00746 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME4O00746 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME4O00746 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME4O00746 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME4O00746 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME4O00746 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME4O00746 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME4O00746 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME4O00746 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME4O00746 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME4O00746 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NME4O00746 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME4O00746 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME4O00746 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME4O00746 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME4O00746 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME4O00746 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME4O00746 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NME4O00746 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME4O00746 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME4O00746 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME4O00746 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms