Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NFIBO00712 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIBO00712 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIBO00712 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIBO00712 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIBO00712 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIBO00712 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIBO00712 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIBO00712 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIBO00712 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIBO00712 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIBO00712 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIBO00712 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIBO00712 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIBO00712 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIBO00712 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIBO00712 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIBO00712 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIBO00712 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIBO00712 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIBO00712 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIBO00712 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIBO00712 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIBO00712 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIBO00712 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIBO00712 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIBO00712 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIBO00712 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFIBO00712 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFIBO00712 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIBO00712 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIBO00712 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIBO00712 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIBO00712 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIBO00712 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIBO00712 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIBO00712 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIBO00712 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIBO00712 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIBO00712 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIBO00712 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIBO00712 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIBO00712 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIBO00712 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIBO00712 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIBO00712 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIBO00712 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIBO00712 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIBO00712 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIBO00712 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIBO00712 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIBO00712 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIBO00712 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIBO00712 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIBO00712 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIBO00712 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIBO00712 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIBO00712 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIBO00712 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIBO00712 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIBO00712 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIBO00712 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIBO00712 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIBO00712 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIBO00712 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIBO00712 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIBO00712 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIBO00712 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIBO00712 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIBO00712 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIBO00712 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIBO00712 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIBO00712 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIBO00712 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms