Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3B1O00203 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3B1O00203 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3B1O00203 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms