Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CROCC2H7BZ55 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CROCC2H7BZ55 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CROCC2H7BZ55 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CROCC2H7BZ55 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms