Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms