Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD8-MDP1E9PL57 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms