Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP99D6REC4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP99D6REC4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms