Protein–RNA interactions for Protein: B4DZS4

TCP11X1, T-complex protein 11 X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11X1B4DZS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCP11X1B4DZS4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCP11X1B4DZS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP11X1B4DZS4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP11X1B4DZS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP11X1B4DZS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCP11X1B4DZS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms