Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1CA8MV81 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HIGD1CA8MV81 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms