Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NOTOA8MTQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NOTOA8MTQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms