Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC53A6NM62 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC53A6NM62 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC53A6NM62 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms