Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NL46 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NL46 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NL46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NL46 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NL46 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NL46 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NL46 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NL46 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NL46 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NL46 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NL46 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NL46 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NL46 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NL46 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NL46 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NL46 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NL46 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NL46 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NL46 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NL46 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NL46 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NL46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NL46 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NL46 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NL46 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NL46 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NL46 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NL46 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NL46 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NL46 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NL46 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NL46 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NL46 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NL46 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NL46 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NL46 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NL46 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NL46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NL46 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NL46 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NL46 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NL46 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NL46 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NL46 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NL46 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NL46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A6NL46 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NL46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NL46 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NL46 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NL46 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NL46 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NL46 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NL46 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NL46 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NL46 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NL46 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NL46 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NL46 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NL46 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NL46 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NL46 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NL46 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.4 ms