Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC85CA6NKD9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC85CA6NKD9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC85CA6NKD9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC85CA6NKD9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms