Protein–RNA interactions for Protein: A6NF01

POM121B, Putative nuclear envelope pore membrane protein POM 121B, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121BA6NF01 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POM121BA6NF01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POM121BA6NF01 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POM121BA6NF01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms