Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRBA1A5PL33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRBA1A5PL33 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRBA1A5PL33 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms