Protein–RNA interactions for Protein: A2RRL7

TMEM213, Transmembrane protein 213, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM213A2RRL7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM213A2RRL7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM213A2RRL7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM213A2RRL7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms