Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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COPS7AQ9UBW8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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