Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLKQ9UBT6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms