Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms