Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMG20AQ9NP66 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms