Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTR3CQ9C0K3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTR3CQ9C0K3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ACTR3CQ9C0K3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTR3CQ9C0K3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms