Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSDMCQ9BYG8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms