Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms