Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms