Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SENP8Q96LD8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 526.9 ms