Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC11Q96DB2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC11Q96DB2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms