Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC35B4Q969S0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms