Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms