Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHMTQ93088 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms