Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRHL3Q8TE85 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRHL3Q8TE85 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms