Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFXN5Q8TD22 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms