Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGSF1Q8N6C5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms