Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf40Q8IXQ3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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C9orf40Q8IXQ3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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