Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P3H3Q8IVL6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
P3H3Q8IVL6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms