Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms