Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TPTE2Q6XPS3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPTE2Q6XPS3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms