Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC62Q6P9F0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms