Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPPQ6IPU0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms