Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CARMIL2Q6F5E8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARMIL2Q6F5E8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms