Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHDC7AQ5VTJ3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHDC7AQ5VTJ3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms