Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF220Q5VTB9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms