Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC27A3Q5K4L6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A3Q5K4L6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms