Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF2Q5BJF6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF2Q5BJF6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms