Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SFT2D3Q587I9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms