Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SP6Q3SY56 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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