Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms